近日，中国农业科学院蜜蜂研究所传粉昆虫资源与育种团队通过实证比较的方式，对种群遗传研究中不同测序策略进行了对比，并在相关实验设计方面给出了建议。相关成果发表在《Genes》。

全基因组测序已成为种群遗传学研究的常规方法，在实验设计中，可采取以个体为单位的测序方法（个体测序，ind-seq）和以群体为单位的测序方法（混池测序，pool-seq）。两种策略各有优缺点，针对不同的研究目的，如何在这两种策略之间取舍？过去的研究主要是利用模拟数据进行了对比，但缺乏使用真实数据集的实证研究。

本研究以欧洲的西方蜜蜂（Apis mellifera）种群为素材，采集了14个种群（包括13个亚种、1347群蜂），分别采取了个体测序和混池测序两种策略进行测序分析，并比较了二者在评估种群遗传结构和遗传参数上的表现。发现二者在揭示基本的种群结构和遗传多样性方面基本一致。在此基础上，个体测序可以进一步提供群体亚结构、杂交或个体异常值识别的信息；而混池测序可用于变异的发现，或与个体测序结合用于特定物种的研究。

该研究得到了国家自然科学基金、国家现代农业产业技术体系、欧盟框架项目Smartbees等的资助。（通讯员 陈晓）

原文链接：

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8872436/?msclkid=c3626fa5b71d11ecab8feccb1506d386